El artículo discute la objeción de consciencia por médicos, teniendo como situación concreta los servicios de aborto legal en Brasil. El artículo presenta las dos principales interpretaciones del dispositivo de la objeción de consciencia (tesis de la incompatibilidad y tesis de la integridad), para analizarlas a la luz de la realidad brasileña del aborto legal en servicios de referencia en la red pública de salud. A partir de estas dos tesis, propone una tercera, la de la justificación, como forma de orientar el ejercicio del derecho a la objeción de conciencia entre médicos en estos servicios. Esta reflexión puede contribuir tanto para la organización de los equipos en los servicios de aborto legal como para la formación de futuros médicos que atenderán mujeres en servicios de emergencia obstétrica.